La IA Podría Desbloquear el Lenguaje de Las Proteínas: Conoce Ankh, el Susurrador de Proteínas

Por Jose Antonio Lanz

¿Y si la IA pudiera hablar con las proteínas? ¿Sabes, esas moléculas grandes y complejas que desempeñan muchos roles críticos en el cuerpo? Bueno, agárrate a tus batas de laboratorio, porque Ankh, un nuevo modelo de lenguaje de proteínas, pretende hacer precisamente eso.

Ankh fue creado por un grupo de expertos de las Universidades de Munich y Columbia en colaboración con la empresa de biotecnología Protinea. El nombre proviene de un antiguo símbolo egipcio que representa la vida, adecuado para un modelo de lenguaje de IA que se adentra en los mismos bloques de construcción de la vida.

Según un artículo de investigación, Ankh aprende el "lenguaje de las proteínas" mediante el análisis de un gran conjunto de datos de secuencias de proteínas, y luego utiliza este conocimiento para crear nuevas secuencias de proteínas e intenta determinar cómo podrían funcionar.

Un modelo de lenguaje proteico como Ankh y un large language model o modelo de lenguaje grande como ChatGPT son similares. En las proteínas, el alfabeto está compuesto por aminoácidos. Estos aminoácidos se enlazan para formar cadenas, algo así como palabras. La secuencia de aminoácidos debe estar en un orden específico para que la proteína se pliegue en la forma tridimensional correcta, lo cual es esencial para su función. Básicamente, es como la forma en que las personas juntan palabras en un idioma específico, siguiendo un conjunto de reglas para comunicarse adecuadamente.

Un modelo de lenguaje grande funciona intentando predecir qué palabra tendría más sentido en una salida específica según una indicación, y Ankh básicamente intenta hacer lo mismo, adivinando qué configuración biológica tendría más sentido para una salida específica, considerando todo lo que sabemos sobre las proteínas y sus reglas estructurales.

Comprender las proteínas (y su lenguaje) es crucial para la biología humana. Juegan un papel clave en la estructura, función y regulación de los tejidos y órganos del cuerpo.

La capacidad de Ankh para analizar y predecir el comportamiento de las proteínas podría ser extremadamente útil en los campos de la medicina, la ciencia ambiental y más. Por ejemplo, en el descubrimiento de medicamentos, Ankh podría usarse para predecir cómo interactuarán las proteínas con varios compuestos, lo que puede acelerar significativamente el desarrollo de nuevos medicamentos.

Además, puede ayudar a los científicos a comprender cómo las mutaciones en las proteínas pueden llevar a enfermedades, lo cual es invaluable en la investigación genética.

Más allá de la medicina, Ankh tiene aplicaciones en la biología sintética, donde se puede utilizar para diseñar nuevas proteínas que exhiban funciones deseadas. Esto tiene implicaciones de gran alcance en campos como la energía renovable y la ciencia de materiales. Al diseñar proteínas que puedan, por ejemplo, descomponer plásticos o producir biocombustibles de manera más eficiente, Ankh puede contribuir a resolver algunos de los desafíos ambientales más apremiantes de nuestro tiempo.

Usos de Ankh. Imagen: Arvix.org

Como informó Decrypt recientemente, OpenAI, el gigante de la IA conocido por desarrollar el generador de imágenes Stable Diffusion, no es ajeno al mundo de las proteínas. También han incursionado en la investigación de proteínas con IA. Con Ankh también en escena, parece que la IA está calentando el campo de la investigación, haciendo que las proteínas sean tan interesantes como pueden serlo.

Ankh está disponible públicamente y se distribuye bajo la Licencia CC BY-NC-SA 4.0, así que si quieres hablar con tus proteínas, adelante.

¿Y qué sigue para Ankh? Los investigadores no dan muchos detalles, pero podemos esperar un rápido desarrollo de nuevas características y mejoras. ¿Y qué hay de Chaos-GPT, la IA empeñada en dominar el mundo? Tal vez quiera considerar asociarse con Ankh. Porque, seamos sinceros: las proteínas gobiernan el mundo.

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